航空运输业：比较淡定 
记者采访国航、深航的相关人士，对方均表示，对于航空业尤其是航空客运，营改增的影响比较小，从长期来看，税负与改革之前是基本平衡的。 
国航深圳分公司副总经理郑伟斌介绍，从上海方面试点的情况看，东航的反应不大，可能税负还相对减少一些。他向记者分析道，税负的增减主要取决于可供扣减的进项有多少，从航空业来说，这部分占比非常大，航空方面占成本最高的购机、航油、航材等都是可以扣除的进项，所以相比较下来税负不会增加。 
业内人士介绍，营改增之后，负担最重的应该是那些人力成本占比较高的企业，比如咨询、服务业。而从航空业来讲，人力成本应该不会超过5%，其中航油就占成本约40%，再加上航材、地面运输车、购机，可扣除的项非常之多。 
对于货运而言，深圳航空运输协会会长聂睿姬表示会有负面影响。但郑伟斌在这方面担忧较少，他介绍，如果把航空的客运和货运整体打包来看，“营改增”的影响还是平衡的。 
陆路运输业：比较愁苦 
相对于航空业的淡定来讲，陆路运输“苦水较多”。深圳市物流与供应链管理协会秘书长郑艳玲分析，一方面是增值税当中可扣除的进项规定不合理，二是税率增加过高。据综合开发研究院物流与供应链管理研究所所长王国文估算，部分陆路运输企业的税负会增加2倍以上。 
王国文介绍，陆路运输中，很多成本无法扣减，以汽车货运为例，交通运输业的成本项主要包括人工成本、路桥费等，这些目前尚不能抵消的成本，约占总运营成本的60%左右。 
从另外一项可扣除的成本即汽车的购买成本来看，郑艳玲介绍，实际上企业也吃亏。企业一般在早年发展期会集中购买一些车辆，但税改之后，同于无法追溯到之前的购买行为，因此这些车就不能扣除。 
外资航运业：可能受益 
那么，运输业当中有没有明显的受益方，对水路运输的行业影响又将如何? 
记者本想采访深圳的港口企业，但对方不发表评论。而据上海的媒体报道，上海的大部分港口企业表示影响较负面。深圳港口协会的相关负责人也表示，影响确实负面。 
但王国文介绍，外资航运业可能受益。他介绍，外资航运业可以将原来的运费到付(收货人付费改为运费预付，将船公司的进项费用加大，这样就可以充分利用营改增的政策，将利润留在海外，将成本转移到境内。 
专家建议 
应重新研究营改增政策 
“营改增”税收政策的改革本意是税收结构的改革，而非税负的增减。目前也有少部分企业如陆路运输业从中受损，这对后者来讲显得非常不公平，也违背了税改的初衷。政府的政策制定者也在考虑相关的配套政策，深圳国税局在其官方网站上表示，“针对深圳市部分具体行业税负增加较多的企业财政补贴方案正在研究制定中”，但专家建议，治本之策应该是重新研究“营改增”的政策，明确进项抵销细则。 
王国文认为要明确进项抵销的细则，使交通运输行业能够与其他服务行业一样，在一个统一的“营改增”的政策框架下，承担公平的纳税义务。

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